35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1536 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  100 
 
 		 84 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  100 
 
 		 83 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  56 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  56.76 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  58.57 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  51.32 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  56.94 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  56.16 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  55.13 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  54.29 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  56.76 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  50.67 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  45.21 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  36.71 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  39.73 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  43.84 
 
 		 321 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  36.71 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  40.85 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  38.16 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  40.85 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  40 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  36.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  37.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  37.66 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  36.62 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  38.57 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  36 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  36 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  36 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  36.49 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  34.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  34.67 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  34.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  32.43 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>