287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3826 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3826  PHP-like  100 
 
 		 289 aa  564  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  0.059434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0890  hypothetical protein  72.33 
 
 		 253 aa  358  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.445222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  54.8 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  52.75 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  52.84 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  51.76 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4259  PHP domain protein  51.23 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  47.24 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  47.57 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  52.75 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  51.25 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  50 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  46.26 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27790  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  50.75 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0386409  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1793  phosphoesterase PHP-like  44.48 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  45.88 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  46.5 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  50.19 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2909  PHP domain protein  48.75 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308532  normal  0.0259754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  44.78 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2480  PHP domain protein  47.45 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0141576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0820  PHP domain protein  46.48 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000400643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0771  PHP domain protein  48.87 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  43.21 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  44.81 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2787  phosphotransferase domain-containing protein  43.73 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  41.54 
 
 		 270 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  38.28 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  39.11 
 
 		 273 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  38.87 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  37.85 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  39.37 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  38.74 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  38.52 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  34.86 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  38.04 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  35.46 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  36.22 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  40.62 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  36.65 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  37.98 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.26 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  36.65 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  42.91 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  38.28 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  36.81 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  37.4 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  41.39 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  35.06 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  37.77 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  29.18 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  33.72 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  33.72 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  37.01 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  37.78 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  33.07 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  39.29 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  38.27 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  39.29 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  35.21 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  38.89 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  37.08 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1985  phosphotransferase domain-containing protein  37.04 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000791669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  37.23 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  32.31 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  31.54 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  35.09 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  34.32 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  34.09 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  31.32 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  35.4 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  34.33 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  37.74 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  34.32 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  35.94 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  35.92 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  36.19 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  34.75 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  36.36 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1941  PHP domain protein  36.5 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  28.24 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  30.53 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  35.59 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5748  PHP domain protein  33.83 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  35.98 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.11 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  34.7 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  31.41 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  34.87 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  33.08 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  33.85 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  34.75 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5249  PHP domain protein  35.36 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  31.64 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  33.07 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  30.74 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  33.21 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  37.05 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>