16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3308 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 500 aa  996    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1954  hypothetical protein  42.46 
 
 		 470 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1899  hypothetical protein  44.85 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  42.22 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  30.98 
 
 		 427 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4418  tetratricopeptide TPR_4  30.8 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1130  hypothetical protein  31.59 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.823409  normal  0.981294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3050  hypothetical protein  30.96 
 
 		 437 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0272  hypothetical protein  38.99 
 
 		 218 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6286  putative HTH-type transcriptional regulator  29.13 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2286  hypothetical protein  34.64 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00221273  hitchhiker  0.000615766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4164  hypothetical protein  33.89 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00796352  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3893  hypothetical protein  55.17 
 
 		 81 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3520  hypothetical protein  24.91 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  30.3 
 
 		 556 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  31.31 
 
 		 545 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>