13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1572 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 319 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  57.1 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  55.49 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.3 
 
 		 545 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  29.64 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  29.57 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  27.17 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  27.27 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  25.87 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  26.67 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  26.55 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1278 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  24.3 
 
 		 755 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>