48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1008 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  100 
 
 		 181 aa  348  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  43.14 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  44.37 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  39.1 
 
 		 163 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  43.4 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  41.61 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  42.28 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  38.62 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  36.65 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  38.96 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  40.94 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  41.25 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  38.03 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  36.3 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  37.68 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  42.95 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  42.11 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  35.46 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  36.25 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  35.44 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  36.48 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  33.54 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  33.87 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  32.91 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  38.71 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  32.3 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  36.91 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  34.48 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  30.88 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  39.25 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  32.8 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  37.29 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  32.3 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  33.58 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  30.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  31.68 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  32.92 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  28.39 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  26.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  26.11 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  26.11 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  30.73 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  27.89 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  28.03 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  31.36 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  31.79 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>