More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0310 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  47.04 
 
 		 812 aa  696    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  44.77 
 
 		 841 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  46.2 
 
 		 812 aa  709    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  45.92 
 
 		 825 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  44.75 
 
 		 826 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  45.11 
 
 		 953 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 		 811 aa  660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  56.78 
 
 		 791 aa  878    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  45.5 
 
 		 820 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  45.24 
 
 		 826 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 		 811 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.5 
 
 		 811 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.5 
 
 		 811 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  45.77 
 
 		 821 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0310  ATPase  100 
 
 		 741 aa  1488    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  43.1 
 
 		 830 aa  668    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  45.62 
 
 		 811 aa  665    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.62 
 
 		 811 aa  663    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.44 
 
 		 851 aa  641    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  44.47 
 
 		 822 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  44.26 
 
 		 932 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  45.89 
 
 		 823 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  44.71 
 
 		 814 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.62 
 
 		 811 aa  662    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  45.88 
 
 		 811 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  45.76 
 
 		 822 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 		 789 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 		 814 aa  673    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  45.1 
 
 		 825 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 		 811 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  45.64 
 
 		 824 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 		 811 aa  660    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  56.66 
 
 		 791 aa  876    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  46.5 
 
 		 830 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  55.09 
 
 		 792 aa  796    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  45.32 
 
 		 810 aa  668    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  44.14 
 
 		 894 aa  643    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  45.45 
 
 		 823 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  45.42 
 
 		 812 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.98 
 
 		 834 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.5 
 
 		 811 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 		 789 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  45.26 
 
 		 829 aa  656    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  43.31 
 
 		 869 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  44.53 
 
 		 837 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  47.24 
 
 		 886 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  44.06 
 
 		 834 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  44.94 
 
 		 818 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  44.31 
 
 		 812 aa  667    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  45.34 
 
 		 792 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  54.45 
 
 		 792 aa  791    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  46.71 
 
 		 825 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  44.11 
 
 		 830 aa  638    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.21 
 
 		 828 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.95 
 
 		 866 aa  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0597  ATPase  65.41 
 
 		 733 aa  1009    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.139339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  45.7 
 
 		 810 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  43.82 
 
 		 850 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  45.34 
 
 		 814 aa  641    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  45.5 
 
 		 829 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  49.69 
 
 		 826 aa  713    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  46.58 
 
 		 812 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  45.48 
 
 		 825 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  42.96 
 
 		 839 aa  642    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.1897600000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  45.76 
 
 		 822 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  53.66 
 
 		 789 aa  788    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  44.84 
 
 		 815 aa  651    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  45.43 
 
 		 816 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  45.95 
 
 		 812 aa  703    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  44.84 
 
 		 813 aa  639    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  45.51 
 
 		 812 aa  700    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  43.81 
 
 		 861 aa  643    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  43.39 
 
 		 835 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  47.11 
 
 		 815 aa  688    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  43.51 
 
 		 817 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  43.28 
 
 		 830 aa  635  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  43.39 
 
 		 824 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.6 
 
 		 836 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  44.01 
 
 		 868 aa  634  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  45.66 
 
 		 930 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  43.85 
 
 		 844 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 851 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.73 
 
 		 844 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  43.03 
 
 		 839 aa  634  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  42.91 
 
 		 854 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  44.36 
 
 		 946 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  43.44 
 
 		 850 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  43.12 
 
 		 902 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  43.94 
 
 		 949 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3836  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.9 
 
 		 825 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.07 
 
 		 854 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  43.78 
 
 		 834 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  43.14 
 
 		 818 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  43.14 
 
 		 818 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  42.51 
 
 		 862 aa  630  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  44.36 
 
 		 946 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  43.39 
 
 		 848 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  42.84 
 
 		 825 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  43.6 
 
 		 853 aa  631  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  44.36 
 
 		 946 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>