26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4910 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  200  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  50.53 
 
 
105 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  52.27 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  51.14 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  49.47 
 
 
445 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  49.38 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  43.01 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  45.12 
 
 
454 aa  77  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  38.68 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  54.69 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  38.37 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  39.78 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  37.63 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 
156 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  34.67 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4911  hypothetical protein  30.91 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  45.83 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  43.75 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13343  hypothetical protein  23.76 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>