56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4001 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4307  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  88.79 
 
 
348 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4001  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  100 
 
 
348 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.641375  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4145  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  88.51 
 
 
348 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4130  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  88.79 
 
 
348 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4248  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  88.79 
 
 
348 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4199  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  88.51 
 
 
348 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03663  Entobacterial Common Antigen (ECA) polysaccharide chain length modulation protein  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0114437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03612  hypothetical protein  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813852  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0658934  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4002  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4136  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4296  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  86.96 
 
 
348 aa  630  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  86.67 
 
 
348 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00115149  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4149  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  86.96 
 
 
348 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4009  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  70.8 
 
 
348 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4201  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  69.62 
 
 
348 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  71.17 
 
 
350 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0183  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  66.57 
 
 
359 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4032  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  66.97 
 
 
358 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.010328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0513  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  66.27 
 
 
339 aa  474  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.283706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0159  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  50.45 
 
 
341 aa  338  9e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
332 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 
326 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  25.3 
 
 
344 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  23.81 
 
 
327 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  23.81 
 
 
326 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  25 
 
 
344 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  23.51 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  26.59 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0598886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  24.4 
 
 
325 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  26.89 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  26.89 
 
 
325 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0412425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  26.89 
 
 
327 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  26.89 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  22.47 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3057  ferric enterobactin transport protein FepE  21.61 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  21.91 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  21.61 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3039  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.443281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  21.61 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0638  ferric enterobactin transport protein FepE  21.61 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0673  ferric enterobactin transport protein FepE  21.61 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  22.47 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  22.19 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  21.55 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3036  ferric enterobactin transport protein FepE  22.64 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.177075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1257  ferric enterobactin transport protein FepE  22.64 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000394328  hitchhiker  0.0000000226828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3177  ferric enterobactin transport protein FepE  22.64 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0490  ferric enterobactin transport protein FepE  21.05 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  20.78 
 
 
377 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0747  ferric enterobactin transport protein FepE  23.08 
 
 
378 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  36.67 
 
 
719 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  36.67 
 
 
719 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  36.67 
 
 
719 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>