62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3969 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  81.61 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  81.94 
 
 
299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  81.61 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  81.61 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  81.61 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  81.94 
 
 
299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  81.94 
 
 
299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  81.27 
 
 
299 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  77.93 
 
 
299 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  77.93 
 
 
299 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  81.27 
 
 
287 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  69.57 
 
 
299 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  69.23 
 
 
299 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  68.01 
 
 
318 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  68.56 
 
 
299 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  54.51 
 
 
295 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.3 
 
 
291 aa  305  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  53.63 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  53.29 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  54.14 
 
 
286 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  51.22 
 
 
287 aa  292  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  51.27 
 
 
292 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  50.88 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  51.21 
 
 
291 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.04 
 
 
289 aa  269  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  48.96 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  51.25 
 
 
292 aa  265  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  51.96 
 
 
290 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  51.97 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  53.76 
 
 
286 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.67 
 
 
293 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  46.07 
 
 
288 aa  257  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  48.48 
 
 
265 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  49.11 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.69 
 
 
291 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.12 
 
 
291 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.12 
 
 
291 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.27 
 
 
290 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.39 
 
 
291 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  45.88 
 
 
292 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  45.05 
 
 
292 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  37.54 
 
 
292 aa  199  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  37.84 
 
 
286 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.22 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  27.11 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  22.86 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.97 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.85 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.68 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  28.7 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4987  hypothetical protein  25.45 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.58 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  22.22 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 
367 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  24.48 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>