65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0024 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0024  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000288736  hitchhiker  0.0000000102811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1934  tRNA-Lys  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.810073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0044  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.462611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000411683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna47  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4583  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0571835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0021  tRNA-Val  93.33 
 
 		 69 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01380  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0844385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4223  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000199522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1335  hypothetical protein  100 
 
 		 207 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.531493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0048  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.780393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0062  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000000673345  normal  0.0836086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4224  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4225  tRNA-Val  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0077  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000297609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2737  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000828053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2738  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000778313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0015  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0016  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0017  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>