48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0753 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  63.29 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  55.7 
 
 		 80 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  43.21 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  40.26 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  40.26 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  47.95 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  46.27 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  37.5 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  36.99 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  34.21 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  42.59 
 
 		 645 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  42.59 
 
 		 645 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  37.5 
 
 		 666 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0086  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  40.62 
 
 		 659 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  40.74 
 
 		 667 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 624 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.41 
 
 		 636 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  30.26 
 
 		 640 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 		 636 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  29.69 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  36.07 
 
 		 666 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  32.84 
 
 		 640 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 		 530 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  31.34 
 
 		 641 aa  43.9  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  42.59 
 
 		 653 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 		 569 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.55 
 
 		 677 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.97 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  29.27 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1845  hypothetical protein  32.2 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 569 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.97 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0531  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.75 
 
 		 163 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00863384  normal  0.0986491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 		 570 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  29.82 
 
 		 623 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  29.82 
 
 		 626 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1087  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.75 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.865762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  33.33 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  28.07 
 
 		 623 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0660  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 592 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_634  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  33.33 
 
 		 157 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.93 
 
 		 597 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>