21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0748 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  100 
 
 
855 aa  1762    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  38.21 
 
 
869 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  34.66 
 
 
844 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  34.66 
 
 
844 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  34.78 
 
 
858 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  35.34 
 
 
858 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  35.34 
 
 
858 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  34.47 
 
 
872 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  32.43 
 
 
870 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  31.7 
 
 
839 aa  333  9e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  30.8 
 
 
792 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  28.8 
 
 
611 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  23.22 
 
 
821 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.73 
 
 
712 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  23.95 
 
 
795 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  25 
 
 
829 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 
827 aa  58.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.69 
 
 
570 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3111  hypothetical protein  29.53 
 
 
169 aa  49.7  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  21.71 
 
 
847 aa  45.8  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  21.71 
 
 
847 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>