21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0051 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0051  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  333  9e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  44.64 
 
 
175 aa  153  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  37.87 
 
 
177 aa  124  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  33.14 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  30.61 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  29.03 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  27.34 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1316  hypothetical protein  30.3 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00105458  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  24.85 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  29.93 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  34.03 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  29.93 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  25.89 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  25.89 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  31.11 
 
 
182 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  25.56 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.44 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  30.3 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  25.52 
 
 
185 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  31.9 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>