12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3518 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3518  fimbrial protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00642189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0150  fimbrial protein  84.77 
 
 		 198 aa  321  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00359988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  41.09 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  44.08 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0152  fimbrial protein  42.78 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00100089  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00140  predicted fimbrial-like adhesin protein  41.24 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0047782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00139  hypothetical protein  41.24 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00369206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3461  Fimbrial protein  41.24 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000984412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0145  fimbrial protein  41.24 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000164783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0132  hypothetical protein  39.47 
 
 		 124 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000008388  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0211  major fimbrial subunit  29.15 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3824  fimbrial protein-like protein  26.9 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>