22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1664 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01891  adhesin  96.78 
 
 		 7152 bp  12260    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  96.78 
 
 		 7104 bp  12260    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  95.9 
 
 		 7863 bp  6421    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0991    94.03 
 
 		 5850 bp  4696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  96.65 
 
 		 7077 bp  12140    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1664    100 
 
 		 7103 bp  14080    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.2959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  96.53 
 
 		 6891 bp  11750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2102    96.46 
 
 		 7152 bp  12070    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000223073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  96.81 
 
 		 7077 bp  12230    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5842    81.56 
 
 		 5037 bp  488  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.697336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  81.34 
 
 		 5241 bp  472  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  78.69 
 
 		 8802 bp  153  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  84.16 
 
 		 4191 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  84.16 
 
 		 4257 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  84.16 
 
 		 4254 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  84.16 
 
 		 4254 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  84.16 
 
 		 888 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  84.16 
 
 		 4254 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  84.16 
 
 		 876 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  84.16 
 
 		 1233 bp  73.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  86.44 
 
 		 2193 bp  54  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  81.63 
 
 		 3255 bp  52  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>