17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0991 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0991    100 
 
 		 5850 bp  11600    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  96.05 
 
 		 7104 bp  5196    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  97.46 
 
 		 7863 bp  10310    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  96.05 
 
 		 7152 bp  5196    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  97.85 
 
 		 7077 bp  5640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1664    94.03 
 
 		 7103 bp  4696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.2959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  96.02 
 
 		 6891 bp  5188    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2102    96.5 
 
 		 7152 bp  5307    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000223073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  96.08 
 
 		 7077 bp  5204    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4773  hypothetical protein  98 
 
 		 300 bp  91.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.518043  normal  0.771182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2284  exonuclease family protein  98 
 
 		 1131 bp  91.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506505  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    97.96 
 
 		 459 bp  89.7  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    97.78 
 
 		 834 bp  81.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    100 
 
 		 339 bp  60  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0219    100 
 
 		 198 bp  60  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  100 
 
 		 309 bp  58  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4589  general L-amino acid transport system permease protein AapM  96.67 
 
 		 1089 bp  52  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>