More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1087 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1087  lyase  100 
 
 		 388 aa  810    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  99.44 
 
 		 466 aa  749    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  68.99 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  67.13 
 
 		 467 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  55.71 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  57.66 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  56.96 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  55.71 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  55.38 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  55.71 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  56.17 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  55.91 
 
 		 485 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  55.12 
 
 		 474 aa  418  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  54.33 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  55 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  53.51 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  55.11 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  55.28 
 
 		 480 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  56.39 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  55.99 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  56.39 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  55.99 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.1 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  53.35 
 
 		 463 aa  398  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  54.6 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  53.66 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  54.6 
 
 		 478 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  52.24 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  52.24 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  52.24 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  53.78 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  54.32 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  55 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  54.32 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  53.95 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  53.78 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  54.44 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  52.11 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  54.32 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  53.3 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  54.32 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  55.56 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  52.83 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  53.24 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  53.5 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  56.27 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  51.7 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  52.77 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  51.96 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  53.3 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  50.66 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  55.7 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  50.66 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  55.7 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3532  aspartate ammonia-lyase  55.05 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.563164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  55.26 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  55.7 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  55.7 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  52.1 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  55.7 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0480  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  51.07 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  51.68 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  52.23 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  51.68 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0506  aspartate ammonia-lyase  55.99 
 
 		 479 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 477 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000442883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  52.65 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  51.68 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  53.02 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  51.45 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  51.46 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  51.68 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0725  aspartate ammonia-lyase  56.27 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  50.41 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  54.49 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  52.76 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  51.39 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>