26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1685 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  99.37 
 
 		 790 aa  1629    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  99.24 
 
 		 790 aa  1624    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  98.99 
 
 		 790 aa  1622    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  99.37 
 
 		 790 aa  1630    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  98.73 
 
 		 790 aa  1619    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  99.11 
 
 		 790 aa  1625    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 790 aa  1640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  98.99 
 
 		 790 aa  1622    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  99.24 
 
 		 790 aa  1624    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 856 aa  319  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 935 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 934 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 867 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  29.07 
 
 		 862 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  27.35 
 
 		 859 aa  265  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  27.3 
 
 		 859 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 908 aa  196  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 879 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  28.09 
 
 		 488 aa  178  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  24.05 
 
 		 841 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 840 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  23.25 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  21.05 
 
 		 746 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  21.38 
 
 		 744 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  21.17 
 
 		 744 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  21.67 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>