192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2618 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01026  predicted outer membrane protein  100 
 
 		 2424 bp  2599    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1626    100 
 
 		 1994 bp  2375    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.449305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  99.69 
 
 		 981 bp  1921    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  94.88 
 
 		 981 bp  1540    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2618    100 
 
 		 3623 bp  7182    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.941681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 981 bp  1945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  94.9 
 
 		 981 bp  1548    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01033  hypothetical protein  100 
 
 		 2424 bp  2599    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1266  outer membrane protein PgaA  99.92 
 
 		 2424 bp  2591    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.632553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  94.7 
 
 		 981 bp  1532    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  94.62 
 
 		 993 bp  1524    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  99.9 
 
 		 981 bp  1937    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  94.62 
 
 		 993 bp  1524    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1144  outer membrane protein PgaA  99.85 
 
 		 2424 bp  2583    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2572  outer membrane protein PgaA  100 
 
 		 2424 bp  2599    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.014315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1142    100 
 
 		 1362 bp  2214    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0584994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1139    100 
 
 		 1038 bp  2058    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175273  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  78.34 
 
 		 981 bp  192  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  78.34 
 
 		 981 bp  192  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  78.21 
 
 		 981 bp  184  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  82.74 
 
 		 981 bp  139  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  77.21 
 
 		 981 bp  121  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  77.21 
 
 		 981 bp  121  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  86.21 
 
 		 981 bp  103  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  91.18 
 
 		 978 bp  87.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  91.18 
 
 		 978 bp  87.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3614    91.18 
 
 		 951 bp  87.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  91.18 
 
 		 978 bp  87.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3935    94.64 
 
 		 947 bp  87.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  88.31 
 
 		 966 bp  81.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  88.31 
 
 		 987 bp  81.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  88.31 
 
 		 987 bp  81.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  94.34 
 
 		 993 bp  81.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  92.45 
 
 		 1338 bp  73.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  92.45 
 
 		 1077 bp  73.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  92.45 
 
 		 1050 bp  73.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  92.45 
 
 		 993 bp  73.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  88.24 
 
 		 966 bp  71.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  82.76 
 
 		 810 bp  71.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0575    88.24 
 
 		 987 bp  71.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0218438  normal  0.0799551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 987 bp  71.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  89.66 
 
 		 951 bp  67.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  84.27 
 
 		 990 bp  65.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  81.9 
 
 		 924 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02541    86.76 
 
 		 894 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  81.9 
 
 		 1218 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  81.9 
 
 		 963 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05555    86.76 
 
 		 927 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  86.76 
 
 		 969 bp  63.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 		 993 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>