23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2115 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  98.36 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  98.36 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  98.36 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  98.36 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  99.01 
 
 		 304 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  98.36 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  98.36 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  48.15 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  47.81 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  47.81 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  47.81 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  47.81 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  47.81 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  47.81 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  47.81 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  47.47 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1764  protein FimH  94.92 
 
 		 59 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3389  fimbrial protein  26.25 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  29.3 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  26.14 
 
 		 355 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0083  fimbrial protein  26.74 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  30.07 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>