More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0453 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 71 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  81.69 
 
 		 71 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  76.81 
 
 		 69 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  70 
 
 		 70 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  68.66 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  63.38 
 
 		 73 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  56.92 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  54.17 
 
 		 74 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 72 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  47.14 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  50.77 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  52.78 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  55.38 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  50 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 71 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  44.29 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  44.29 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  44.29 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  47.22 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  45.83 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  52.24 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  43.66 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  45.83 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  43.66 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  42.25 
 
 		 72 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>