More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3645 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  100 
 
 
74 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  97.3 
 
 
74 aa  150  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  73.13 
 
 
72 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  68.92 
 
 
74 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1303  50S ribosomal protein L31  77.42 
 
 
75 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  62.5 
 
 
73 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  64 
 
 
75 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  64.79 
 
 
71 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  66.18 
 
 
86 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  70.15 
 
 
70 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  64.29 
 
 
71 aa  104  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  67.16 
 
 
82 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  68.66 
 
 
70 aa  103  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  68.66 
 
 
75 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  65.67 
 
 
71 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  63.89 
 
 
81 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  63.89 
 
 
81 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  63.89 
 
 
81 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  67.16 
 
 
67 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  65.67 
 
 
71 aa  100  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  65.67 
 
 
69 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  65.67 
 
 
70 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  63.77 
 
 
72 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  60.56 
 
 
74 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
69 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  64.18 
 
 
69 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
75 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0323  ribosomal protein L31  62.69 
 
 
69 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.100308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 
70 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 
75 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  60.56 
 
 
76 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 
80 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  59.46 
 
 
74 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 
74 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  58.33 
 
 
72 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  64.62 
 
 
68 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  59.7 
 
 
70 aa  94.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
68 aa  93.6  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
70 aa  90.9  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  54.79 
 
 
94 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  61.19 
 
 
69 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  52.7 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
72 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  53.52 
 
 
70 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  52.11 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  53.52 
 
 
70 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  54.17 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  54.55 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  57.97 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  54.17 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  54.93 
 
 
70 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  51.52 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  54.93 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  47.22 
 
 
72 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1285  ribosomal protein L31  67.16 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  48.61 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  53.52 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  54.17 
 
 
73 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  47.22 
 
 
72 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  61.29 
 
 
73 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
66 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
69 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 
71 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
66 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
67 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  52.78 
 
 
71 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  55.07 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  56.34 
 
 
75 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  52.78 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  52.78 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  55.07 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  52.78 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 
66 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  50 
 
 
71 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
65 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 
66 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 
68 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>