64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2951 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  70.2 
 
 
208 aa  288  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  68.56 
 
 
203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  59.47 
 
 
206 aa  224  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  47.31 
 
 
202 aa  184  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  47.57 
 
 
198 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  46.37 
 
 
198 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  49.42 
 
 
195 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  37.2 
 
 
210 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  38.5 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  40.56 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  36.84 
 
 
208 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  42.13 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  36.65 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  35.45 
 
 
226 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  40.88 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  38.64 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  37.78 
 
 
212 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  38.82 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  37.29 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  36.67 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  38.3 
 
 
242 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  38.33 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  45.66 
 
 
215 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  34.36 
 
 
251 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  43.98 
 
 
215 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  40.98 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  38.98 
 
 
210 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  36 
 
 
209 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  38.33 
 
 
204 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  38.67 
 
 
201 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  35.79 
 
 
206 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  36 
 
 
209 aa  104  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  34.81 
 
 
209 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  35.43 
 
 
209 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  37.44 
 
 
221 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  35.43 
 
 
209 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  38.55 
 
 
185 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  35.43 
 
 
209 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  35.43 
 
 
209 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  35.42 
 
 
202 aa  101  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  34.87 
 
 
203 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  36.46 
 
 
202 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  36.46 
 
 
202 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  37.02 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  37.02 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  34.5 
 
 
194 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  43.1 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  35.03 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  35.38 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  33.88 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  35.56 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  35.5 
 
 
207 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  36.93 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  35.26 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  29.53 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  30.52 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  36.09 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.218767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>