23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3363 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  53.33 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  54.41 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  46.43 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  46.43 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2597  hypothetical protein  49.3 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  hitchhiker  0.000125377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  47.76 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  46.67 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  35.21 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  37.97 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  39.74 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  39.06 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  27.72 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  35.82 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  34.15 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  31.33 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  38.03 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  34.09 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  31.82 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  32.94 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  32.35 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>