More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0934 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0934  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  226  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  69.12 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  64.06 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  64.06 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  64.06 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  64.06 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  62.5 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  61.76 
 
 		 393 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  57.81 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  57.81 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  57.81 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 97 aa  90.5  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2763  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.577864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  60.94 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  54.41 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  55.88 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2623  transposase IS3/IS911  57.81 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  0.218597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3222  transposase IS3/IS911  57.81 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.170867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3527  transposase IS3/IS911  57.81 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3727  transposase IS3/IS911  57.81 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  54.41 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  54.41 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  54.41 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  54.41 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  54.41 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 370 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  51.56 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  51.56 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  51.56 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  51.56 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  55.74 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  53.97 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3396  hypothetical protein  55.88 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  47.06 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  48.53 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  53.97 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  49.21 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  50 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2460  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 298 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  52.63 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0379  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  55.56 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  48.53 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  50.79 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0108  transposase IS3/IS911  44.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2022  transposase IS3/IS911  44.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2784  transposase IS3/IS911  44.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  62.75 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1624  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  53.23 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2424  transposase IS3/IS911  51.52 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4851  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  51.56 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>