22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0802 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0802  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3678  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit  45.92 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5980  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.03 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223945  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2032  TRAP transporter permease component  25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  24.26 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.65 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4869  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.02 
 
 		 159 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120214  normal  0.368894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.31 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6027  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  19.83 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0227633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6124  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.6 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0246328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5662  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  19.83 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.652959  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6517  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  19.83 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3869  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.03 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499764  normal  0.600837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0446  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.28 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156898  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7435  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  20.54 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07670  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  29.22 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5884  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.81 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3271  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  30.34 
 
 		 619 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373435  normal  0.294977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1797  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ (4TM)subunit  22.22 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107972  hitchhiker  0.000251501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1350  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.22 
 
 		 171 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>