More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1904 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  48.36 
 
 		 688 aa  660    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0503  elongation factor G  56.32 
 
 		 698 aa  751    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1092  elongation factor G  53.07 
 
 		 683 aa  699    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  54.95 
 
 		 680 aa  744    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  47.38 
 
 		 689 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  47.28 
 
 		 692 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1904  elongation factor G  100 
 
 		 682 aa  1396    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  57.36 
 
 		 682 aa  769    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.3 
 
 		 691 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  48.51 
 
 		 680 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  51.34 
 
 		 706 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  46.6 
 
 		 692 aa  631  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  46.3 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  47.84 
 
 		 697 aa  631  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.38 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  46.15 
 
 		 692 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  46.23 
 
 		 692 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.93 
 
 		 692 aa  625  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.71 
 
 		 690 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  45.49 
 
 		 689 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  45.71 
 
 		 692 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  45.52 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  45.12 
 
 		 692 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  45.33 
 
 		 689 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.55 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  44.56 
 
 		 691 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  45.51 
 
 		 689 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  44.82 
 
 		 704 aa  613  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  45.11 
 
 		 704 aa  611  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  47.11 
 
 		 693 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  45.19 
 
 		 697 aa  611  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  44.82 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  43.55 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  45.66 
 
 		 694 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  45.66 
 
 		 694 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  45.69 
 
 		 704 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  44.73 
 
 		 691 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  46.09 
 
 		 698 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  45.59 
 
 		 692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  46.55 
 
 		 689 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  46.77 
 
 		 695 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  45.94 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  44.82 
 
 		 692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  45.76 
 
 		 697 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  45.26 
 
 		 706 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  46.56 
 
 		 695 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  45.94 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  44.46 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.44 
 
 		 700 aa  601  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  44.31 
 
 		 691 aa  599  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  44.71 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.08 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  44.71 
 
 		 704 aa  596  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  44.31 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  43.68 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  44.41 
 
 		 699 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.03 
 
 		 689 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  44.17 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.72 
 
 		 715 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  43.93 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  45.32 
 
 		 691 aa  598  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03950  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.27 
 
 		 698 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  44.38 
 
 		 690 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  46.26 
 
 		 698 aa  593  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  45.06 
 
 		 691 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  44.58 
 
 		 697 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  44.31 
 
 		 691 aa  595  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  45.48 
 
 		 704 aa  595  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  44.41 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  44.38 
 
 		 704 aa  594  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  44.71 
 
 		 704 aa  595  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  44.36 
 
 		 696 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  45.33 
 
 		 695 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  43.09 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  43.07 
 
 		 693 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  44.23 
 
 		 694 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  44.96 
 
 		 700 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  43.89 
 
 		 699 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  45.39 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  44.28 
 
 		 698 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  44.43 
 
 		 697 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  45.69 
 
 		 699 aa  591  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.08 
 
 		 697 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  45.68 
 
 		 700 aa  589  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  43.05 
 
 		 697 aa  591  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  45.63 
 
 		 691 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  43.93 
 
 		 691 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  45.58 
 
 		 701 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  44.3 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  44.13 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  44.05 
 
 		 709 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  44.13 
 
 		 697 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  43.66 
 
 		 692 aa  588  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  44.33 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  44.1 
 
 		 704 aa  588  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  44.93 
 
 		 700 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  46.36 
 
 		 701 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  43.89 
 
 		 699 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  42.92 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  44.64 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>