27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0824 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  33.57 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  32.01 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  30.14 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  34.12 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  41.21 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  43 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.49 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.89 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 145 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  35.14 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  30.27 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  23.87 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.48 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  23.87 
 
 		 157 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 161 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 148 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>