50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3275 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  76.22 
 
 		 152 aa  236  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  51.43 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  37.14 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  36.43 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  37.14 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  36.43 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  37.24 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  41.58 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  37.59 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  31.85 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  34.29 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  35.97 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  31.62 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  36.45 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  32.62 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  31.47 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  29.37 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  34.42 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  30.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  30.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  30.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  30.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  30.72 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  29.56 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  24.86 
 
 		 314 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  27.56 
 
 		 308 aa  44.7  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 300 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  27.5 
 
 		 327 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0132  GTP-binding protein LepA  33.88 
 
 		 605 aa  43.9  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.872254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  27.16 
 
 		 307 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  27.78 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  26.32 
 
 		 481 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1563  GTP-binding protein LepA  30.58 
 
 		 603 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  26.99 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  25.81 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  26.22 
 
 		 301 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  33.72 
 
 		 544 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1726  GTP-binding protein LepA  27.13 
 
 		 598 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0972683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  28.81 
 
 		 310 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>