More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3121 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3121  IS21 family transposase  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  41.59 
 
 		 252 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  41.59 
 
 		 252 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  41.59 
 
 		 252 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  41.59 
 
 		 252 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4904  IstB ATP binding domain-containing protein  44.86 
 
 		 262 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4774  IstB ATP binding domain-containing protein  42.99 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 255 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 255 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 255 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0198  IstB domain protein ATP-binding protein  43.93 
 
 		 262 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6528  IstB domain protein ATP-binding protein  43.93 
 
 		 262 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4736  IstB ATP binding domain-containing protein  41.12 
 
 		 262 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2512  IstB ATP binding domain-containing protein  41.12 
 
 		 262 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.931109 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5654  IstB ATP binding domain-containing protein  41.12 
 
 		 262 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  39.62 
 
 		 262 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4394  IstB  37.61 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  38.68 
 
 		 275 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  35.85 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  35.85 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  35.85 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  37.38 
 
 		 256 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6240  IstB ATP binding domain-containing protein  39.25 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2296  IstB ATP binding domain-containing protein  39.25 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0017  IstB ATP binding domain-containing protein  39.25 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  36.45 
 
 		 280 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  37.4 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  38.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  38.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  38.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  38.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  38.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  38.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  37.74 
 
 		 262 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 259 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 259 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  40 
 
 		 221 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  34.23 
 
 		 265 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0021  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1564  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2885  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0579  IstB ATP binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 283 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3369  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  35.85 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3143  IS21 transposase orfB  34.23 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  34.62 
 
 		 252 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  35.48 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 248 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0096  putative insertion sequence ATP-binding protein  35.85 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.234743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  35.48 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 264 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0018  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0056  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0193  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0291  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0832  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0864  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2322  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000340663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2388  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0695654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2741  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3014  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3225  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3432  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0345153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3607  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.525084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4014  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4270  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4626  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4729  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4768  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5576  ISPsy4, transposition helper protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  35.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  35.51 
 
 		 272 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  39.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  39.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  39.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  39.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  39.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  39.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>