More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3143 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3143  IS21 transposase orfB  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  96.13 
 
 		 265 aa  354  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  92.66 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3369  IS21 family transposition helper protein  93.79 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0096  putative insertion sequence ATP-binding protein  92.14 
 
 		 143 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.234743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  47.31 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  47.31 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  44.97 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  44.97 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1555  IstB domain protein ATP-binding protein  46.25 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0506  IstB domain protein ATP-binding protein  46.25 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1508  IstB domain protein ATP-binding protein  46.25 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.305327  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  46.71 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  39.34 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  39.34 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  39.34 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  39.34 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  44.51 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  44.51 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  44.51 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  44.51 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  44.63 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  44.63 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  44.63 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  44.63 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  44.51 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  44.32 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  43.17 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  43.17 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  37.43 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  43.53 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  43.53 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0786  IstB domain protein ATP-binding protein  41.92 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  41.92 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  41.92 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  40.45 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  41.92 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  41.92 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  40.54 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  40 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  40 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  40 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  40 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  40 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  40 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0579  IstB ATP binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  41.5 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  43.43 
 
 		 259 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  43.43 
 
 		 259 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  43.43 
 
 		 259 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  39.33 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  37.34 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  42.51 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  44.58 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  37.34 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  40 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  42.94 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  42.94 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5576  ISPsy4, transposition helper protein  42.94 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  42.94 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>