31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0366 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0366  membrane protein  100 
 
 
79 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  63.24 
 
 
292 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  55.88 
 
 
321 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  42.11 
 
 
300 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  40.51 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  40.51 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  40.51 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  40.51 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  40.51 
 
 
302 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  40.51 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  39.24 
 
 
302 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  39.24 
 
 
302 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  40.51 
 
 
304 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  44.74 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.56 
 
 
298 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  43.42 
 
 
300 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  43.42 
 
 
300 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  39.39 
 
 
328 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  42.11 
 
 
300 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  42.11 
 
 
300 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.19 
 
 
312 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 
299 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.92 
 
 
319 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  38.6 
 
 
298 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.81 
 
 
296 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.47 
 
 
327 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 
313 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>