More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1860 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1860  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
423 aa  873    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000293735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3456  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.15 
 
 
412 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000737722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.94 
 
 
381 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.3 
 
 
385 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.2 
 
 
381 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0762  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.74 
 
 
381 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  0.783766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.01 
 
 
380 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.7 
 
 
380 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  36.94 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  36.94 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.54 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
379 aa  216  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.68 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.27 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.98 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.13 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.81 
 
 
383 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  35.11 
 
 
379 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  32.27 
 
 
410 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.24 
 
 
376 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.98 
 
 
399 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  34.84 
 
 
379 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 
401 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  31.07 
 
 
410 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 
379 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.94 
 
 
381 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
410 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
376 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
376 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.85 
 
 
379 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
376 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.26 
 
 
379 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
376 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
376 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.01 
 
 
382 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
381 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  36.72 
 
 
379 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.57 
 
 
379 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.26 
 
 
376 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  34.31 
 
 
379 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
379 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.38 
 
 
380 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
379 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
379 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
379 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.19 
 
 
390 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1248  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.2 
 
 
415 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.22 
 
 
389 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
379 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
376 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  35.51 
 
 
378 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
379 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  33.85 
 
 
379 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 
375 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.66 
 
 
379 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.08 
 
 
641 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.04 
 
 
375 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.04 
 
 
377 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.69 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.04 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.07 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.67 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.95 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
404 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.23 
 
 
393 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.43 
 
 
397 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.01 
 
 
380 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.45 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
414 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.242601  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.75 
 
 
642 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.85 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.04 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.69 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  33.76 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.92 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.06 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.53 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37799  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.25 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  33.68 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.6 
 
 
561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.97 
 
 
414 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.65 
 
 
393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.25 
 
 
400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>