15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3536 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3536  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  30.46 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  25.85 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  24.84 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  31.58 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  30.7 
 
 
185 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  29.09 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  31.69 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  30.32 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.345909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  34.62 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  25.93 
 
 
163 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0994  N-terminal methylation protein  30.63 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2705  hypothetical protein  28.86 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.349315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>