30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2969 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2969  single-strand binding protein  100 
 
 		 352 aa  712    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  35.17 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 277 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  31 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2524  single-strand binding protein  32.75 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000823265  normal  0.0673427 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2964  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2840  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  29.49 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.08 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 163 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 159 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 157 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 158 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 165 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 171 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 142 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  35 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  25.64 
 
 		 142 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  28 
 
 		 191 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 184 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  28.04 
 
 		 148 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 		 172 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  28.04 
 
 		 148 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 222 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>