26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1417 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1222    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  52.33 
 
 
577 aa  548  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  49.5 
 
 
585 aa  532  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  48.66 
 
 
582 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  48.66 
 
 
582 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  49.39 
 
 
580 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  47.67 
 
 
578 aa  465  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  46.05 
 
 
589 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  47.74 
 
 
613 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  37.44 
 
 
571 aa  372  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  38.47 
 
 
630 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  33.71 
 
 
611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  33.71 
 
 
611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  30.4 
 
 
682 aa  138  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.42 
 
 
508 aa  53.9  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  28.85 
 
 
1071 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  20.69 
 
 
560 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  25.48 
 
 
607 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  27.52 
 
 
496 aa  47.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  25 
 
 
557 aa  47.4  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  24.38 
 
 
466 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  27.12 
 
 
1106 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  27.93 
 
 
544 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  28.12 
 
 
250 aa  44.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.56 
 
 
531 aa  43.9  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  26 
 
 
524 aa  43.9  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>