226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4486 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4486  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
258 aa  534  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698126  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1699  Glucosamine-6-phosphate deaminase  59.67 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297803  normal  0.026904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6213  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  53.85 
 
 
255 aa  280  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3109  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  51.23 
 
 
254 aa  265  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.25876  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3353  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.64 
 
 
274 aa  244  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1521  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.15 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00621711  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2696  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  44.94 
 
 
259 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2627  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.96 
 
 
269 aa  208  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4629  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.32 
 
 
258 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2098  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
255 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2142  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.36 
 
 
255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784311  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4443  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.96 
 
 
257 aa  195  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5244  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.6 
 
 
259 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.965081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3264  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.7 
 
 
257 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0591  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.49 
 
 
259 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.858991  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0774  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.7 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.37 
 
 
255 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.51 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.25 
 
 
262 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.09 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.65 
 
 
262 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1394  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.71 
 
 
254 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.807703  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 
241 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.63 
 
 
236 aa  121  9e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.35 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.91 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.24 
 
 
251 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 
233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.94 
 
 
242 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.24 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.61 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.8 
 
 
276 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.39 
 
 
266 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.68 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.07 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.99 
 
 
262 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.49 
 
 
263 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.64 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.64 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.64 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.53 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.64 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.35 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.64 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 
250 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.39 
 
 
266 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.72 
 
 
641 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  30.27 
 
 
637 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.19 
 
 
261 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 
249 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.32 
 
 
263 aa  106  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 
252 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 
252 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.05 
 
 
266 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.98 
 
 
266 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.98 
 
 
266 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.57 
 
 
253 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 
253 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 
260 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.94 
 
 
268 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.29 
 
 
242 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
234 aa  105  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.83 
 
 
266 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.91 
 
 
242 aa  104  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.8 
 
 
303 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.05 
 
 
266 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.98 
 
 
266 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
262 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.53 
 
 
266 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  29.71 
 
 
260 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  30.57 
 
 
358 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
255 aa  102  5e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.37 
 
 
256 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.87 
 
 
266 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.56 
 
 
670 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.48 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.98 
 
 
266 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.09 
 
 
260 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>