39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3251 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  54.73 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  50.51 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  29.94 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  28.15 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  26.02 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  26.16 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  27.14 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  26.71 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  26.35 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  27.59 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  25.25 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  24.25 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  32.43 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  24.07 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  28.22 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  28.22 
 
 		 528 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  34.69 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  27.22 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  28.16 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  27.37 
 
 		 538 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  24.27 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  21.85 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  32.06 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  24.38 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  24.47 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  29.89 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  28.4 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  32.59 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  23.86 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  32.59 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  32.59 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  32.59 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  32.59 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  32.59 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  23.17 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42896  predicted protein  25.89 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  36.61 
 
 		 1394 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  24.67 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>