32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1836 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  100 
 
 		 534 aa  1093    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  37.38 
 
 		 506 aa  316  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  36.05 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  27.71 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  29.35 
 
 		 514 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  30.41 
 
 		 548 aa  94  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  29.6 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  30.26 
 
 		 503 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  34.62 
 
 		 536 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  34.62 
 
 		 536 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1838  hypothetical protein  36.7 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.327344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  29.48 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  28.64 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  26.62 
 
 		 599 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  25.37 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  25 
 
 		 850 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  41.67 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  41.67 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  25.09 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  41.67 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  43.33 
 
 		 535 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  24.71 
 
 		 300 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  26.75 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  25.83 
 
 		 904 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  26.18 
 
 		 416 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  31.31 
 
 		 247 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  31.31 
 
 		 247 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  25.46 
 
 		 971 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  41.67 
 
 		 343 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07060  tyrosinase (AFU_orthologue; AFUA_1G17430)  37.14 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.044074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  27.2 
 
 		 874 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  24.75 
 
 		 279 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>