78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0481 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  100 
 
 		 511 aa  1052    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  36.58 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  33.5 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  32.39 
 
 		 406 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  32.12 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.63 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  30.61 
 
 		 398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  30.17 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  32.03 
 
 		 411 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  28.57 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  30.32 
 
 		 407 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  28.57 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.19 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.18 
 
 		 369 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  25.66 
 
 		 400 aa  103  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.92 
 
 		 369 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.92 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.92 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.73 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.85 
 
 		 369 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.71 
 
 		 372 aa  96.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.85 
 
 		 372 aa  96.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.96 
 
 		 373 aa  93.6  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.06 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.67 
 
 		 372 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  28.67 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  27.99 
 
 		 372 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.96 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.91 
 
 		 367 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.91 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.91 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.81 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.91 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.3 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.58 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  26.58 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  26.91 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  25.44 
 
 		 348 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  24.36 
 
 		 365 aa  67  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  24.36 
 
 		 365 aa  67  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  27.37 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13730  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  26.59 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125718  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2427  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase  24.11 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.363581  normal  0.253558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  28.57 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2541  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  27.4 
 
 		 426 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2764  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  27.4 
 
 		 426 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.479963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  24.42 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2997  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  28.65 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3102  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  31.37 
 
 		 426 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1656  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  29.21 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0812  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  26.14 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0281  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  25.58 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4596  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  32.35 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  24.88 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  28.57 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2469  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  27.67 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0978551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2667  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  30.39 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338224  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2181  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  27.06 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2048  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  33 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  27.82 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1124  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  27.7 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000369055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  23.21 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0171  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  23.28 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4332  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  32.35 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.351551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06040  O-acetylhomoserine sulfhydrolase  29.3 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  26.62 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  26.62 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2703  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  29.41 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.221221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  26.62 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  26.25 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0668  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.88 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2458  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  33.63 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1420  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  30.6 
 
 		 425 aa  43.5  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3249  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  23.9 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000823089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  27.86 
 
 		 475 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>