29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2315 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  819    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  45.82 
 
 
382 aa  348  9e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2522  hypothetical protein  41 
 
 
404 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.101837  normal  0.542859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04270  hypothetical protein  39.45 
 
 
388 aa  306  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2120  hypothetical protein  39.45 
 
 
389 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  38.48 
 
 
382 aa  278  9e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.66 
 
 
388 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.27 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26.37 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  26.55 
 
 
411 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  27.88 
 
 
437 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.86 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.36 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  21.83 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.49 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.04 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  27.92 
 
 
891 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.78 
 
 
900 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.78 
 
 
914 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  22.71 
 
 
429 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  26.97 
 
 
327 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
896 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
894 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
904 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
904 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25 
 
 
418 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
926 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
912 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 
924 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>