More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1552 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0691  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  67.46 
 
 		 1193 aa  1669    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.145468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0874  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  69.57 
 
 		 1197 aa  1697    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0416  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  76.65 
 
 		 1192 aa  1879    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134571 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1552  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 1191 aa  2455    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.014569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2080  phosphoenolpyruvate synthase  73.72 
 
 		 1194 aa  1839    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0332499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1329  PEP-utilising enzyme, mobile region  75.68 
 
 		 1191 aa  1862    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.110408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  36.78 
 
 		 1115 aa  279  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 825 aa  228  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  34.46 
 
 		 779 aa  226  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  45.11 
 
 		 788 aa  224  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  34.13 
 
 		 795 aa  224  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  33.98 
 
 		 803 aa  222  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  34.06 
 
 		 795 aa  222  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  36.97 
 
 		 793 aa  218  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  42.96 
 
 		 794 aa  217  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  42.96 
 
 		 794 aa  217  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  32.32 
 
 		 821 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  46.8 
 
 		 791 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  37.68 
 
 		 791 aa  214  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.05 
 
 		 769 aa  213  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  45.24 
 
 		 795 aa  213  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  44.4 
 
 		 789 aa  213  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 		 797 aa  213  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  33.01 
 
 		 819 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  44.57 
 
 		 790 aa  212  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  46.77 
 
 		 801 aa  212  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.72 
 
 		 754 aa  211  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  30.98 
 
 		 815 aa  211  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 		 806 aa  211  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  42.69 
 
 		 795 aa  211  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 832 aa  211  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  45.56 
 
 		 803 aa  211  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  45.34 
 
 		 804 aa  210  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  38.69 
 
 		 794 aa  210  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  44.62 
 
 		 792 aa  210  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  44.62 
 
 		 792 aa  210  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 792 aa  209  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 837 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  42.7 
 
 		 809 aa  209  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  31.16 
 
 		 839 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  31.94 
 
 		 839 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  46.28 
 
 		 795 aa  208  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  44.76 
 
 		 795 aa  208  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 790 aa  208  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  44.4 
 
 		 790 aa  207  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  46.28 
 
 		 795 aa  207  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  43.68 
 
 		 815 aa  207  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  32 
 
 		 812 aa  207  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  42.75 
 
 		 799 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  42.75 
 
 		 799 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  32.94 
 
 		 789 aa  207  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  33.78 
 
 		 790 aa  207  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  43.85 
 
 		 792 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  43.58 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  43.85 
 
 		 792 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  44.06 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  43.85 
 
 		 792 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  43.85 
 
 		 792 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  43.45 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  43.58 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  43.58 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  43.85 
 
 		 792 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  42.64 
 
 		 787 aa  205  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  46.69 
 
 		 799 aa  206  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  45.38 
 
 		 798 aa  206  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  42.54 
 
 		 800 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  43.68 
 
 		 791 aa  205  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  33.07 
 
 		 806 aa  205  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  42.54 
 
 		 800 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  42.54 
 
 		 800 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  43.19 
 
 		 778 aa  205  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  44.06 
 
 		 791 aa  205  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  32.36 
 
 		 803 aa  205  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  37.8 
 
 		 794 aa  204  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  45.45 
 
 		 799 aa  204  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  43.58 
 
 		 790 aa  204  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 		 792 aa  204  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 		 791 aa  204  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  38.97 
 
 		 795 aa  204  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  43.51 
 
 		 800 aa  204  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  38.65 
 
 		 790 aa  204  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  43.13 
 
 		 801 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  43.09 
 
 		 800 aa  204  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  31.96 
 
 		 838 aa  204  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  31.12 
 
 		 801 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  38.04 
 
 		 792 aa  204  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  42.54 
 
 		 800 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.22 
 
 		 782 aa  203  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  32.82 
 
 		 792 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.12 
 
 		 795 aa  202  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  40.77 
 
 		 805 aa  202  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>