30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0598 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0598  cyclase family protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0920009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0509  cyclase family protein  42.78 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.876245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3839  cyclase family protein  37.31 
 
 
183 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.302477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1756  cyclase family protein  34.15 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30.94 
 
 
219 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.79 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.57 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  27.39 
 
 
236 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.19 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.79 
 
 
210 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.79 
 
 
210 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  28.66 
 
 
254 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.79 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.79 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.79 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.47 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.79 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.79 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.28 
 
 
212 aa  44.7  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.19 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  34.23 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  26.94 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  30.9 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.81 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  31.43 
 
 
377 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  31.67 
 
 
308 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.53 
 
 
210 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  26.63 
 
 
222 aa  42  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  33.03 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>