17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1230 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3345  hypothetical protein  57.85 
 
 		 118 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  42.65 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  34.55 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  33.33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  36.23 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  35.9 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  36.23 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  30 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1321  hypothetical protein  28.18 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4133  transcriptional regulator-related protein  24.64 
 
 		 125 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30.26 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.82 
 
 		 261 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  34.67 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1732  bacteriophage CI repressor  27.94 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000144956  normal  0.557146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 219 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>