34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0306 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  50.83 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.95 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.59 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  37.72 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  41.43 
 
 		 149 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  32.94 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  34.97 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  29.03 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2520  Redoxin domain protein  28.78 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.1 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  23.68 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  25.41 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.84 
 
 		 447 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  26.45 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1959  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.29 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0360363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  23.42 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2474  thiol:disulfide interChange protein DsbE  27.97 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4024  thiol:disulfide interChange protein DsbE  27.97 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4041  thiol:disulfide interChange protein DsbE  27.97 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.75 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4096  thiol:disulfide interchange protein DsbE  27.97 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2432  thiol:disulfide interchange protein DsbE  27.97 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.74056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.67 
 
 		 422 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 		 166 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5359  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.07 
 
 		 226 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720042  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4145  thiol:disulfide interchange protein DsbE  27.12 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.37 
 
 		 446 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  23.53 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2488  thiol:disulfide interchange protein DsbE  27.12 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.881771  normal  0.015378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3613  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.09 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  23.53 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>