More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4007 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  100 
 
 
222 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  83.18 
 
 
223 aa  391  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  70.45 
 
 
221 aa  342  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4594  6-phosphogluconate phosphatase  70.59 
 
 
221 aa  323  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.348928  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4240  6-phosphogluconate phosphatase  65.32 
 
 
222 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4188  6-phosphogluconate phosphatase  65.32 
 
 
222 aa  295  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274934  hitchhiker  0.00681346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  64.86 
 
 
222 aa  294  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  60.91 
 
 
221 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  60.91 
 
 
221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  60.91 
 
 
221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  60.91 
 
 
221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  60.45 
 
 
221 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  58.64 
 
 
221 aa  280  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  60.63 
 
 
221 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  57.73 
 
 
221 aa  275  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.107109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  58.37 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  58.37 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  58.37 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  58.37 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  58.37 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.37 
 
 
221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  56.82 
 
 
221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  39.13 
 
 
237 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  40.98 
 
 
222 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  39.89 
 
 
225 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.76 
 
 
223 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
215 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  36.19 
 
 
226 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
212 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  35.75 
 
 
204 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  38.22 
 
 
227 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  36.15 
 
 
217 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  41.15 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  34.43 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
230 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
217 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.64 
 
 
232 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
228 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  33.49 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  32.74 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  34.7 
 
 
227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.76 
 
 
228 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  34.5 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  35.05 
 
 
216 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  32.72 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  32.6 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.41 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
260 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  28.49 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  35.23 
 
 
240 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  35.23 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  30.85 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.33 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  32.52 
 
 
223 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.03 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.03 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  33.02 
 
 
218 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
244 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
244 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
228 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
228 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
245 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  31.75 
 
 
228 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  32.29 
 
 
225 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  32.04 
 
 
223 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.8 
 
 
228 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  31.22 
 
 
228 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.21 
 
 
229 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  30.36 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.59 
 
 
240 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  34.85 
 
 
230 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
219 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
237 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  29.78 
 
 
230 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  30.36 
 
 
228 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  30.36 
 
 
228 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  30.36 
 
 
228 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.36 
 
 
228 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  30.36 
 
 
228 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
235 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  30.73 
 
 
229 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.21 
 
 
229 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 
228 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.87 
 
 
229 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  29.63 
 
 
232 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  29.63 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
232 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>