45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0655 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
174 aa  343  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  72.99 
 
 
174 aa  234  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  70 
 
 
175 aa  227  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  70.41 
 
 
175 aa  227  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  61.18 
 
 
174 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  60.12 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  60.12 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  60.12 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  44.44 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  35.76 
 
 
155 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  33.13 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  31.18 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  33.14 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  35.59 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  33.9 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  33.9 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  31.43 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  33.9 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  33.9 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  35.59 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  33.54 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  37.25 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  30.25 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  29.19 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  26.71 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  27.67 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  28.48 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  27.04 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  30.14 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  29.94 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  33.94 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  33.94 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  33.94 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  30.2 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0988  hypothetical protein  26.42 
 
 
102 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000290361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  37.08 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2655  hypothetical protein  33.75 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2525  hypothetical protein  33.75 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  37.08 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  26.92 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  35.62 
 
 
100 aa  41.6  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  35.62 
 
 
114 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>