27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4456 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  28 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  28 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  28 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  28.48 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  34.02 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  27.1 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  26 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  29.63 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  34.02 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  33.67 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  27.04 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  29.01 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  27.16 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  33.67 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  25.31 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  25.32 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  31.63 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  31.63 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  31.63 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  31.63 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  25.17 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  28.83 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>