44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0507 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  44.76 
 
 
181 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  46.94 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  51.47 
 
 
321 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  43.75 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  52 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  43.04 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  46.05 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  48.61 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  46.05 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  44.3 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  42.31 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  48.57 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  43.75 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  47.95 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  46.58 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  47.37 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  48.65 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  48.05 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  44.3 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  48.65 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  44.29 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  44.74 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  44 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  46.05 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  46.05 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  45.33 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  44.29 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  45.95 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  44.59 
 
 
120 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  40 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  44.59 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  44.29 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  41.89 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  36.62 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  37.14 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  35.9 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  36.36 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  36 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  36 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  35.71 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  33.8 
 
 
82 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  31.94 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>