34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4467 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4467  NifZ  100 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  78.57 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  70.67 
 
 		 77 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  73.61 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  74.32 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  60.27 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  66.2 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  62.5 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  57.75 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  55.56 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  54.29 
 
 		 83 aa  84.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  54.29 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  59.46 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  57.53 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  38.36 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  38.36 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  35.62 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  39.47 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  32.39 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  35.21 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  32.43 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  36.49 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  32.86 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  33.8 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  38.6 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  32.88 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  32.39 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  32.39 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  32.88 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  33.9 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  33.9 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  31.94 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  28 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>